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市卫生局是市政府主管全市卫生工作的职能部门，主要职责是：
（一）贯彻执行党和国家卫生工作方针、政策和法律、法规，拟制有关卫生工作的地方性法规草案、规章、技术标准。
（二）制定全市卫生事业发展总体规划和战略目标，以及重大疾病防治、初级卫生保健、卫生人才培养等单项规划，并组织实施，对省会及全市医疗工作实行指导。
（三）贯彻“预防为主”方针，组织指导全市急慢性传染病、地方病、职业病的防治的妇幼卫生工作。
（四）依据卫生法规、标准，对食品卫生、社会公共卫生、劳动卫生、药品、血液、医用生物制品和生物材料、医疗器械行使监督职权，对重点疾病及医疗质量等实行监测，实行医务人员资格认可和医疗机构从业许可证制度。
（五）加强中医行业发展战略统筹规划和有关政策的研究，充分发挥战略规划、政策的导向作用，加强中医行业的建设，建立和完善检查机制，加强中医行业的信息、统计工作，负责全市中医工作的管理，继承和发展中医药学，促进中医事业发展。
（六）制定全市重点医学科学研究规划，组织科研攻关，推动医药科技工作为人民健康服务；协同有关部门负责组织、指导卫生专业职务的评审工作。
（七）制定医学继续教育规划，加强在职培训，有计划地培养卫生技术人才。
（八）搞好全市卫生技术人员职业道德教育和法制教育，加强思想政治工作，促进卫生行业的社会主义精神文明建设。
（九）负责卫生外事和援外医疗工作，积极促进国际间的医药卫生技术交流与合作。
（十）建立与完善全市卫生、信息系统，管理卫生统计与信息工作。
（十一）遇有重大突发事件和自然灾害，在市政府统一领导下，组织调度全市卫生技术力量，协助抢救伤员，防止和控制疾病的发生和蔓延。
（十二）承办市政府交办的其他事项。
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